在世界尽头咏唱恋曲的少女YU-NO

主人公有马拓也幼年丧母，
身为历史学家的父亲也在两个月前因事故去世了。

在对一切失去活力的高中生最后的暑假里。
有一天，收到了一个包裹，里面装有用途不明的圆镜和镶着玻璃球的奇怪物体。
附带的信内容有着可以认为父亲还活着的内容……?!

“今晚10点，带着这个物体去剑之岬（三角山）。”

按照指示去了那里，神秘的女性倒在那里。
那里也有校长和神秘的转校生的身影。

瞬间，随着大地的回响，一切被光芒包围......
在平行世界中穿梭的旅行，现在开始了。